Assessment of Body Morphometry to Classify Two Colombian Creole Pigs Using Statistical and Machine Learning Methods
Abstract
:1. Introduction
2. Materials and Methods
2.1. Study Site
2.2. Animals Sampled
2.3. Measured Variables
2.4. Statistical Analysis
3. Results
4. Discussion
5. Conclusions
Author Contributions
Funding
Institutional Review Board Statement
Informed Consent Statement
Data Availability Statement
Acknowledgments
Conflicts of Interest
References
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Creole Pig | Variable | Mean | SD | CV (%) | Minimum | Maximum |
---|---|---|---|---|---|---|
“Casco de Mula” | BW (kg) | 30.4 | 21.9 | 72.0 | 7.1 | 150.0 |
TP (cm) | 69.4 | 14.6 | 21.0 | 44.0 | 131.0 | |
BL (cm) | 58.2 | 11.9 | 20.4 | 38.0 | 120.0 | |
HaW (cm) | 48.6 | 8.7 | 17.9 | 31.0 | 78.0 | |
SH (cm) | 24.8 | 4.5 | 18.3 | 12.0 | 34.0 | |
KP (cm) | 15.0 | 2.8 | 18.9 | 9.0 | 25.0 | |
HL (cm) | 21.6 | 3.8 | 17.5 | 15.0 | 40.0 | |
HW (cm) | 8.3 | 1.9 | 22.4 | 5.5 | 17.0 | |
LEL (cm) | 15.1 | 2.6 | 17.4 | 9.9 | 22.0 | |
LEW (cm) | 10.6 | 2.0 | 19.0 | 7.0 | 19.0 | |
REL (cm) | 15.1 | 2.5 | 16.6 | 10.0 | 23.0 | |
REW (cm) | 10.5 | 1.9 | 18.1 | 7.0 | 16.0 | |
PCP (cm) | 16.0 | 6.9 | 43.3 | 10.0 | 62.0 | |
HH (cm) | 19.4 | 2.9 | 15.0 | 15.0 | 29.0 | |
San Pedreño | BW (kg) | 40.8 | 30.8 | 75.6 | 14.7 | 125.0 |
TP (cm) | 75.1 | 17.3 | 23.0 | 57.0 | 120.0 | |
BL (cm) | 63.1 | 13.5 | 21.4 | 41.0 | 91.0 | |
HaW (cm) | 47.2 | 12.0 | 25.4 | 14.0 | 68.0 | |
SH (cm) | 22.0 | 5.6 | 25.6 | 12.5 | 33.0 | |
KP (cm) | 18.3 | 4.3 | 23.4 | 13.0 | 31.0 | |
HL (cm) | 23.5 | 4.4 | 18.7 | 17.0 | 33.0 | |
HW (cm) | 9.9 | 1.3 | 13.0 | 7.0 | 13.0 | |
LEL (cm) | 15.9 | 3.2 | 19.8 | 10.0 | 22.0 | |
LEW (cm) | 11.4 | 1.7 | 15.0 | 9.0 | 17.0 | |
REL (cm) | 16.0 | 3.3 | 20.9 | 11.0 | 23.0 | |
REW (cm) | 11.6 | 1.7 | 14.7 | 9.0 | 17.0 | |
PCP (cm) | 17.7 | 3.8 | 21.6 | 13.0 | 28.0 | |
HH (cm) | 19.7 | 2.3 | 11.5 | 16.0 | 23.0 |
LDA | Observed | LR | Observed | ||
---|---|---|---|---|---|
Predicted | CM | SP | Predicted | CM | SP |
CM | 46 | 7 | CM | 48 | 10 |
SP | 8 | 23 | SP | 6 | 20 |
QDA | Observed | CT | Observed | ||
Predicted | CM | SP | Predicted | CM | SP |
CM | 45 | 9 | CM | 52 | 5 |
SP | 9 | 21 | SP | 2 | 25 |
Model | LDA | QDA | LR | CT |
---|---|---|---|---|
Accuracy | 0.82 | 0.79 | 0.81 | 0.92 |
Sensitivity | 0.85 | 0.83 | 0.89 | 0.96 |
Specificity | 0.77 | 0.70 | 0.67 | 0.83 |
Precision | 0.87 | 0.83 | 0.83 | 0.91 |
NPV | 0.74 | 0.7 | 0.77 | 0.93 |
MCC | 0.61 | 0.53 | 0.58 | 0.82 |
Error rate | 0.18 | 0.21 | 0.19 | 0.08 |
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Salamanca-Carreño, A.; Vélez-Terranova, M.; Parés-Casanova, P.M.; Toalombo-Vargas, P.A.; Rangel-Pachón, D.E.; Castillo-Pérez, A.F. Assessment of Body Morphometry to Classify Two Colombian Creole Pigs Using Statistical and Machine Learning Methods. Life 2025, 15, 693. https://doi.org/10.3390/life15050693
Salamanca-Carreño A, Vélez-Terranova M, Parés-Casanova PM, Toalombo-Vargas PA, Rangel-Pachón DE, Castillo-Pérez AF. Assessment of Body Morphometry to Classify Two Colombian Creole Pigs Using Statistical and Machine Learning Methods. Life. 2025; 15(5):693. https://doi.org/10.3390/life15050693
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APA StyleSalamanca-Carreño, A., Vélez-Terranova, M., Parés-Casanova, P. M., Toalombo-Vargas, P. A., Rangel-Pachón, D. E., & Castillo-Pérez, A. F. (2025). Assessment of Body Morphometry to Classify Two Colombian Creole Pigs Using Statistical and Machine Learning Methods. Life, 15(5), 693. https://doi.org/10.3390/life15050693